Các buổi bảo vệ đã được tổ chức tại Bộ môn vào các ngày 17 - 18 tháng 9, 8 - 9 và 10 tháng 10 năm 2011. Đã có 1 NCS Ngoại Tiêu hóa, 13 học viên CK2 Ngoại Tiêu hóa, Ngoại Tiết niệu, Ngoại chung, 6 Bác sĩ Nội trú Ngoại và 17 học viên Cao học được phép bảo vệ luận án, luận văn. Hội đồng đánh giá luận văn, luận án bao gồm tất cả các giảng viên cơ hữu và kiêm nhiệm có trình độ TS của Bộ môn đã xem xét nghiêm túc việc thực hiện đề tài và viết luận văn. Đa số các học viên đã được Hội đồng yêu cầu chỉnh sửa luận văn về hình thức cũng như nội dung và đề xuất cho bảo vệ cấp Trường; cá biệt có một số học viên phải sửa chữa lớn luận văn và trình lại Hội đồng mới được bảo vệ cấp cao hơn.